C’est en 1981 que le MHDP accueille le legs du photographe Albert Perronne (1891-1982). Au bénéfice d’une licence en chimie-minéralogie à Paris (1913), puis d’un doctorat obtenu à Lausanne, Albert Perronne tient le commerce de chaussures de ses parents à Porrentruy entre 1919 et 1954. Passionné par les sciences naturelles, l’archéologie et la géologie, il explore cavernes et gouffres à la ronde. En 1948, il acquiert un avion "Piper" et passe son brevet de pilote. Il commence alors à observer le Jura et ses plissements géologiques d’en haut, faisant œuvre de pionnier par des photographies de paysages en vues aériennes.
Entre 1932 et 1974, Perronne immortalise l’actualité et la vie socio-culturelle de l’Ajoie et du Jura en général. Armé de son appareil Leica, il réalise en quelque cinquante ans plus de 28'000 documents photographiques, qu’il consigne chronologiquement et précisément dans 16 cahiers. A l’âge de 90 ans, Albert Perronne fait don de ses négatifs et de sa collection : 709 films de 36 poses, 455 plaques stéréoscopiques et 223 plaques de verre, ainsi que 1156 diapositives.
Le tout est numérisé et constitue une documentation visuelle de première importance sur les événements du passé de la région.

En 1986, les négatifs photographiques du pharmacien Pierre Nicolet (1885-1985) de Saint-Imier sont déposés au MHDP. Ce sont 188 films négatifs noir-blanc et couleur, 78 diapositives, 124 tirages, 2 films 8mm sur le Doubs et la flore du Chasseral. Pierre Nicolet photographie sa région de 1937 à 1984, avec une prédilection pour les sciences naturelles.
Dans ce fonds se trouvent les seules photos du passage des troupes françaises aux Enfers lors de leur internement en 1940. En effet, Nicolet est alors l’un des photographes officiels de l'Armée suisse durant la Deuxième Guerre mondiale et effectue à ce titre un reportage sur « l'internement des troupes françaises dans les Franches-Montagnes des 19 et 20 juin 1940 ».

En 2001, Ernest Leuenberger (*1922), photographe à Porrentruy, lègue au Musée sa collection de négatifs et tirages photographiques des années 1946 à 1978.
Leuenberger débute en 1946 comme photographe professionnel à Porrentruy, où il ne cesse toute sa vie durant d’immortaliser les portraits de la population locale.
Durant quarante-cinq ans, M. Leuenberger réalise de nombreux reportages : mariages, fêtes catholiques, premières messes, enterrements, etc.