Le Musée de l’Hôtel-Dieu s’attache à garder la mémoire des artistes locaux. Ainsi, de nombreux tableaux d’artistes bruntrutains et ajoulots se trouvent dans la collection, notamment ceux de Willi Nicolet (1901-1942), Léon Prêtre (1860-1936), Louis Poupon (1907-1970), Maurice Lapaire (1905-1997), Tristan Solier (1918-1998), Jean-François Comment (1919-2002), Gérard Bregnard (1920-2003), Angi (1936-2000) ou encore Stéphane Montavon (*1960).

D’autres artistes jurassiens sont également représentés : Albert Schnyder (1898-1989), Joseph Lachat (1908-1991), Coghuf (1905-1976), Laurent Boillat (1911-1985), Gérard Tolck (1943-2005) pour n’en citer que quelques-uns. Des sculpteurs tels que Robert Dietlin (1881-1959) ou Willy Vuilleumier (1898-1983) sont également présents dans la collection.

Lors d’expositions personnelles ou collectives au MHDP, les artistes sont invités à déposer une œuvre afin de garder une trace de leur passage et enrichir les collections. Cette œuvre est parfois une peinture sur toile, mais aussi bien souvent un dessin ou une estampe – composante d’ailleurs essentielle de la collection du Musée.